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De nombreuses méthodes sont utilisées pour neutraliser et éliminer les spores dans le lait et le lactosérum. Les spores sont particulièrement difficiles à éliminer, de par leur robustesse, et elles résistent parfois à la pasteurisation, aux rayons UV et gamma, à la congélation, à la dessiccation et aux traitements chimiques. Cependant, ces approches dégradent considérablement la qualité du produit, consomment de l'énergie et nuisent à l'environnement.
Une méthode efficace et respectueuse de l'environnement pour réduire considérablement le nombre de bactéries et de spores consiste à recourir à la microfiltration par membranes céramiques, qui assure une réduction allant jusqu'à 6 log. Les bactéries et les spores sont éliminées du flux de produit, ainsi que les enzymes bactériennes et les cellules somatiques.